tirto.id - Baru-baru ini, media di seluruh dunia dihebohkan dengan berita tentang varian baru SARS-CoV-2, virus yang bertanggung jawab atas COVID-19.
Varian baru virus Corona yang pertama kali diidentifikasi oleh para peneliti di Inggris itu disebut B.1.1.7.
Meskipun para ilmuwan mulai mengungkapkan keprihatinannya, dokumen awal pemerintah Inggris menjulukinya VUI - 202012/01, singkatan dari "varian pertama yang diselidiki di Desember 2020. ”
Dokumen pemerintah kemudian dari bulan Desember menetapkannya sebagai "varian perhatian," dan menyebutnya sebagai VOC 202012/01.
B.1.1.7 pertama kali terlihat di Inggris pada September 2020. B.1.1.7 mulai menarik perhatian komunitas ilmiah dan otoritas pemerintah pada awal Desember, ketika sekretaris kesehatan Inggris, Matt Hancock, menyarankan bahwa itu menyebar dengan cepat dan kemungkinan besar berkontribusi pada meningkatnya jumlah infeksi SARS-CoV-2 di Inggris Selatan, demikian dikutip BBC.
Dan saat ini varian baru virus Corona B.1.1.7 itu telah terlihat setidaknya di 33 negara.
Berikut ini hal-hal tentang apa itu mutasi virus, bagaimana kaitannya dengan perkembangan strain virus baru, dan mengapa varian SARS-CoV-2 baru yang diidentifikasi di Inggris menjadi perhatian seperti dilansir laman Medical News Today.
Mengapa Virus COVID-19 Bermutasi?
Virus memang rentan terhadap mutasi dan semua materi genetik, termasuk manusia, dapat bermutasi ketika terjadi kesalahan selama replikasi.
Mutasi virus terjadi bila ada perubahan urutan genetiknya. Ini menciptakan variasi dan mendorong evolusi virus.
Mutasi menyebabkan perubahan pada protein yang dikodekan dalam kode genetik virus. Perubahan ini bisa menguntungkan, merugikan, atau netral.
Lalu berapa banyak mutasi yang diperlukan untuk menghasilkan jenis virus baru? Secara umum, jika virus memiliki mutasi yang cukup untuk membuat biologinya berbeda secara signifikan, ia dapat dianggap sebagai jenis baru.
Ini berarti bahwa virus mungkin merespons secara berbeda terhadap vaksin atau perawatan, atau dapat menginfeksi spesies yang berbeda atau menularkan dengan cara yang berbeda.
Tetapi jika biologi virus secara luas tetap sama, meskipun ada mutasi, istilah "varian" mungkin lebih akurat secara ilmiah.
Sejak awal pandemi, ada banyak diskusi tentang mutasi SARS-CoV-2 dan apa implikasinya. SARS-CoV-2, seperti banyak virus Corona lainnya, memiliki enzim yang mengoreksi kode genetiknya selama replikasi, mengurangi laju mutasi.
Walaupun virus Corona varian baru memiliki genom yang relatif stabil, dibandingkan dengan jenis virus lain, kadang-kadang ia bermutasi, dan para ilmuwan telah memantau perubahan ini dengan cermat.
Salah satu mutasi yang paling banyak dibicarakan telah menghasilkan varian D614G. Hal ini menyebabkan perubahan protein lonjakan, yang berinteraksi dengan reseptor ACE2 pada sel manusia untuk memfasilitasi masuknya virus.
Secara khusus, asam amino dalam protein lonjakan pada posisi 614 diubah dari asam aspartat menjadi glisin.
Penelitian Dr. Bette Korber dari Laboratorium Nasional Los Alamos, di New Mexico, dan rekannya menunjukkan bahwa perubahan ini memungkinkan varian untuk menginfeksi orang dengan lebih mudah.
Penelitian menunjukkan, varian D614G telah menjadi varian utama SARS-CoV-2 di seluruh dunia dan datanya menyebutkan bahwa orang dengan varian virus D614G mungkin memiliki tingkat RNA virus yang lebih tinggi daripada orang dengan varian asli. Tetapi tidak ada bukti yang menunjukkan bahwa ini menyebabkan COVID-19 yang lebih parah.
Namun, tidak semua ilmuwan setuju dengan interpretasi kelompok ini. Merujuk pada makalah tersebut, Dr. Nathan Grubaugh, dari Yale School of Public Health, di New Haven, CT, dan rekannya berkomentar, diperlukan lebih banyak penelitian untuk mendukung gagasan bahwa varian ini memang lebih dapat menular.
Sementara para peneliti terus mempelajari perbedaan antara varian D dan G, dunia telah mengalihkan fokusnya ke B.1.1.7 dan bagaimana hal itu dapat membentuk jalannya pandemi.
B.1.1.7 dan Efek Pendiri
Varian B.1.1.7 memiliki 23 mutasi. Enam menyebabkan tidak ada perubahan urutan asam amino virus. Dari 17 mutasi yang tersisa, delapan memengaruhi protein spike.
Perubahan N501Y, yang melibatkan peralihan dari asparagin ke tirosin pada posisi 501, terletak di domain pengikat reseptor protein lonjakan. Ini adalah bagian penting, karena berinteraksi langsung dengan reseptor ACE2.
Mutasi lain dalam RNA yang mengkode protein lonjakan memungkinkan para peneliti untuk mendeteksi varian ini dalam sampel uji polymerase chain reaction (PCR). Hal ini karena mutasi terletak di salah satu area target yang digunakan oleh banyak tes PCR diagnostik.
Tes ini juga menggunakan target lain, biasanya kombinasi dari setidaknya dua. Ilmuwan dapat mencari tes PCR yang negatif untuk urutan lonjakan tetapi positif untuk target lainnya. Ini akan menunjukkan bahwa orang tersebut memiliki varian B.1.1.7 dari virus SARS-CoV-2.
Peneliti dari Public Health England menggunakan metode ini untuk melacak penyebaran varian dalam populasi Inggris dan memperkirakan bagaimana penularannya dibandingkan dengan varian sebelumnya.
Tetapi mempelajari betapa mudahnya virus menular dari satu orang ke orang lain secara teknis menantang. Data epidemiologi dapat memberikan model, dan investigasi laboratorium terhadap dinamika infeksi dapat mengungkap lebih detail. Studi semacam itu sedang berlangsung.
Beberapa ilmuwan telah mempertanyakan apakah varian B.1.1.7 memiliki tingkat penularan yang lebih tinggi, menunjukkan bahwa tingginya jumlah kasus infeksi ini mungkin diakibatkan oleh efek pendiri.
Efek pendiri adalah istilah yang digunakan oleh para ilmuwan yang mempelajari evolusi. Ini menetapkan bahwa sekelompok kecil individu dapat memunculkan populasi baru.
Dalam konteks virus, efek pendiri dapat menjelaskan bagaimana B.1.1.7 menyebar dengan sangat cepat. Para peneliti telah menyarankan bahwa kejadian superspreading dan peningkatan tingkat infeksi di seluruh Inggris mungkin menjadi alasan untuk sejumlah besar infeksi dengan varian B.1.1.7.
“Meskipun ini awalnya dianggap mungkin ketika varian pertama kali diidentifikasi pada September, bukti semakin menunjukkan hal ini tidak mungkin dan sekarang sebagian besar telah dikesampingkan,” kata Prof. Martin Hibberd, seorang profesor penyakit menular yang muncul di London School of Hygiene and Tropical Medicine (LSHTM), di Inggris.
Prof Jonathan Stoye, pemimpin kelompok di The Francis Crick Institute, di London, yang labnya mempelajari interaksi host virus juga menyatakan, bahwa virus meskipun mungkin memberikan kontribusi pada penyebaran awal varian baru, tampaknya tidak mungkin menjelaskan insiden kasus yang meningkat pesat, mengingat peningkatan simultan dalam proporsi varian di beberapa pengaturan.
"Sebaliknya, tampaknya tingkat pelepasan virus yang lebih tinggi, mungkin disebabkan oleh infeksi pada lebih banyak sel, menyebabkan tingkat penularan virus yang lebih tinggi," tambahnya.
Editor: Agung DH
