SatuSehat dinilai rentan alami penyalahgunaan data terlebih aplikasi tersebut menyimpan rekam medis pasien yang seharusnya tak boleh diakses pihak ketiga.
Tentang kerahasian data pengguna SatuSehat nantinya, Menkes Budi menyebut aplikasi super itu nantinya akan bekerja layaknya pertukaran data antar Bank.