Pemikiran dan kiprah Mukti Ali yang paling menonjol adalah mengkampanyekan kerukunan beragama semasa Orde Baru. Ia juga membidani lahirnya jurusan ilmu perbandingan agama di IAIN.
Situasi antara Kosovo dan Serbia kembali memanas setelah kereta Serbia bertuliskan "Kosovo adalah Serbia" hendak melintasi perbatasan. Sejak berabad-abad lalu, kondisi dua daerah ini memang pelik. Ada konflik lama terkait perbedaan agama dan etnis.