Sejarah kerajaan Islam di Maluku dimulai sejak abad 8. Kerajaan Tidore dan Ternate tumbuh, tapi hancur akibat konflik internal dan intervensi kolonial.
Sebelum diadili Portugis, Ratu Nukila yang pernah memimpin Kesultanan Ternate dibaptis dengan nama Donna Isabella. Ia menjadi korban fitnah dan kriminalisasi.