Sejarah Hagia Sophia telah melewati era lebih dari 15 abad dan menjadi saksi bisu berlangsungnya transisi banyak rezim yang menguasai Konstantinopel (kini Istanbul).
Sejumlah kontroversi timbul setelah Presiden Turki Erdogan secara resmi menjadikan Hagia Sophia kembali menjadi masjid. Salah satunya terkait penjualan bangunan itu kepada Sultan Mehmet.
Hagia Sophia adalah gereja, adalah masjid, adalah museum. Ia juga dipercaya dibangun di atas pondasi kuil pagan. Pada apse, ada mosaik Bunda Maria sedang menggendong bayi Yesus, juga ada kaligrafi Allah dan Muhammad.