Proses pengangkatan badan kapal (salvage) Nanggala-402 menemui sejumlah kesulitan; kapal berada di kedalaman 839 meter dan bobot kapal selam yang berat.
Tim kesulitan mengangkat badan kapal lantaran penyelam membutuhkan peralatan khusus agar tak membahayakan jiwa untuk mengaitkan cantolan ke KRI Nanggala.